La géothermie profonde exploite des réservoirs situés à grande profondeur (plus de 200m et jusqu’à plusieurs km). L’eau géothermale est une saumure non potable, qui peut présenter un taux de salinité 10 fois supérieur à l’eau de mer. Il ne s’agit pas de l’eau présente dans les nappes phréatiques, qui, en Alsace, sont situées à quelques mètres de profondeur. Au niveau des puits géothermiques, les nappes phréatiques sont entièrement isolées et protégées par une triple barrière de tubages et de cimentation.